課程資訊
課程名稱
生態資料探勘與分析
Ecological Data Mining and Analysis 
開課學期
100-2 
授課對象
生物資源暨農學院  森林環境暨資源學研究所  
授課教師
關秉宗 
課號
Forest7050 
課程識別碼
625 M2510 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三5,6,7,8,9(12:20~17:20) 
上課地點
木性 
備註
限碩士班以上
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1002EDMBTGuan 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

生態資料常具複雜之特性,如具時間與空間之相關性,非線性結構等。是以分析此類資料常非僅修習過基礎統計之研究生所能勝任。本課程之目標乃在經由一系列分析方法之介紹與案例分析,使生態領域之研究生瞭解與分析其所蒐集之資料,並協助其以最精簡有效之方式呈現其資料特性 

課程目標
修習本課程之學生將會使用R統計軟體分析,管理與繪製其資料;並將瞭解與正確地運用廣義線型模式(Generalized Linear Model),廣義加成模式(General Additive Model),非參數分析方法(Nonparametric methods),半參數分析方法(Semi-parametric methods),混合效應模式(Mixed-effects model)等方法於資料分析上 
課程要求
欲修習本課程之學生必須修習過統計學,瞭解線型模式(迴歸與變方分析)之基礎觀念,並需自備筆記型電腦與欲分析之資料 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週四 14:00~15:00 
指定閱讀
None 
參考書目
Borcard, D., Gillet, F., Legendre, P., 2011. Numerical Ecology with R. Springer [electronic resource]
Horton, N., Kleinman, K., 2011. Using R for Data Management, Statistical Analysis, and Graphics. CRC Press [electronic resource]
Henry, M., Stevens, H., 2009. A Primer of Ecology with R. Springer [electronic resource]
Sarkar, D., 2008. Lattice: Multivariate Data Visualization with R. Springer [electronic resource]
Zuur, A.F., Ieno, E.N., Smith, G.M., 2007. Analysing Ecological Data. Springer [electronic resource]
Murrell, P., 2006. R Graphics. CRC Press [electronic resource]
Ecology and Ecological Modeling in R, 2007. Special Issue in the Journal of Statistical Software Vol. 22 (1).
其他補充資料
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
報告(含書面及口頭報告)  
100% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/22  Review of Probability Theory and Distributions 
第2週
2/29  Review of Estimation and Hypothesis Testing 
第3週
3/07  Introduction to R 
第4週
3/14  Data Presentation: Basic R Graphics 
第5週
3/21  Review of Linear Model (Linear Regression and ANOVA) 
第6週
3/28 
Introduction to Generalized Linear Model 
第7週
4/04  Introduction to Generalized Linear Model (Cont.) 
第8週
4/11  Advance R Graphics Using Lattice and Grid 
第9週
4/18  R Programming and Data Analysis (Project Progress Report) 
第10週
4/25  Introduction to Mixed-effects Model 
第11週
5/02  Introduction to Mixed-effects Model (Cont.) 
第12週
5/09  Introduction to Nonparametric Analysis (LOESS) 
第13週
5/16  Introduction to Nonparametric Analysis (Smoothing Splines) 
第14週
5/23  Introduction to General Additive Model 
第15週
5/30  Introduction to General Additive Model (Cont.) 
第16週
6/06 
Introduction to General Additive Mixed-effects Model 
第17週
6/13  Project Report 
第18週
6/20  Project Report